Computational Genomics
Phylogenetic Profiles

Operon predictions using phylogenetic profiles

Last update (mm/dd/yyyy): 04/06/2007

These files contain operon predictions at a confidence value of 0.90 for all the genomes available at the time we started the work:

Moreno-Hagelsieb G and Janga SC (2007) Operons and the effect of genome redundancy in deciphering functional relationships using phylogenetic profiles. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. In press.

The files will be updated later on as more genomes become available. The predictions were obtained with phylogenetic profiles generated using a non-redundant genome dataset filtered at a genomic similarity score of 0.70 (see NR_genomes).

The format:

ENJOY!
  1. A_aeolicus.cv-0_90.igd
  2. A_aurescens_TC1.cv-0_90.igd
  3. A_avenae_citrulli_AAC00-1.cv-0_90.igd
  4. A_bacterium_Ellin345.cv-0_90.igd
  5. A_borkumensis_SK2.cv-0_90.igd
  6. A_cellulolyticus_11B.cv-0_90.igd
  7. A_dehalogenans_2CP-C.cv-0_90.igd
  8. A_ehrlichei_MLHE-1.cv-0_90.igd
  9. A_fulgidus.cv-0_90.igd
  10. A_hydrophila_ATCC7966.cv-0_90.igd
  11. A_marginale_St_Maries.cv-0_90.igd
  12. A_pernix.cv-0_90.igd
  13. A_phagocytophilum_HZ.cv-0_90.igd
  14. A_tumefaciens_C58_Cereon.cv-0_90.igd
  15. A_tumefaciens_C58_UWash.cv-0_90.igd
  16. A_variabilis_ATCC29413.cv-0_90.igd
  17. Acidovorax_JS42.cv-0_90.igd
  18. Acinetobacter_ADP1.cv-0_90.igd
  19. Arthrobacter_FB24.cv-0_90.igd
  20. Azoarcus_BH72.cv-0_90.igd
  21. Azoarcus_EbN1.cv-0_90.igd
  22. B_abortus_9-941.cv-0_90.igd
  23. B_adolescentis_ATCC15703.cv-0_90.igd
  24. B_afzelii_PKo.cv-0_90.igd
  25. B_anthracis_Ames.cv-0_90.igd
  26. B_anthracis_Ames_0581.cv-0_90.igd
  27. B_anthracis_Sterne.cv-0_90.igd
  28. B_aphidicola.cv-0_90.igd
  29. B_aphidicola_Cc.cv-0_90.igd
  30. B_aphidicola_Sg.cv-0_90.igd
  31. B_bacilliformis_KC583.cv-0_90.igd
  32. B_bacteriovorus.cv-0_90.igd
  33. B_bronchiseptica.cv-0_90.igd
  34. B_burgdorferi.cv-0_90.igd
  35. B_cenocepacia_AU1054.cv-0_90.igd
  36. B_cenocepacia_HI2424.cv-0_90.igd
  37. B_cepacia_AMMD.cv-0_90.igd
  38. B_cereus_ATCC10987.cv-0_90.igd
  39. B_cereus_ATCC14579.cv-0_90.igd
  40. B_cereus_ZK.cv-0_90.igd
  41. B_cicadellinicola_Hc.cv-0_90.igd
  42. B_clausii_KSM-K16.cv-0_90.igd
  43. B_floridanus.cv-0_90.igd
  44. B_fragilis_NCTC9434.cv-0_90.igd
  45. B_fragilis_YCH46.cv-0_90.igd
  46. B_garinii_PBi.cv-0_90.igd
  47. B_halodurans.cv-0_90.igd
  48. B_henselae_Houston-1.cv-0_90.igd
  49. B_japonicum.cv-0_90.igd
  50. B_licheniformis_ATCC14580.cv-0_90.igd
  51. B_licheniformis_DSM13.cv-0_90.igd
  52. B_longum.cv-0_90.igd
  53. B_mallei_ATCC23344.cv-0_90.igd
  54. B_mallei_NCTC10229.cv-0_90.igd
  55. B_mallei_SAVP1.cv-0_90.igd
  56. B_melitensis.cv-0_90.igd
  57. B_melitensis_Abortus.cv-0_90.igd
  58. B_parapertussis.cv-0_90.igd
  59. B_pennsylvanicus_BPEN.cv-0_90.igd
  60. B_pertussis.cv-0_90.igd
  61. B_pseudomallei_1710b.cv-0_90.igd
  62. B_pseudomallei_K96243.cv-0_90.igd
  63. B_quintana_Toulouse.cv-0_90.igd
  64. B_subtilis.cv-0_90.igd
  65. B_suis_1330.cv-0_90.igd
  66. B_thailandensis_E264.cv-0_90.igd
  67. B_thetaiotaomicron_VPI-5482.cv-0_90.igd
  68. B_thuringiensis_Al_Hakam.cv-0_90.igd
  69. B_thuringiensis_konkukian.cv-0_90.igd
  70. B_xenovorans_LB400.cv-0_90.igd
  71. Buchnera_sp.cv-0_90.igd
  72. Burkholderia_383.cv-0_90.igd
  73. C_abortus_S26_3.cv-0_90.igd
  74. C_acetobutylicum.cv-0_90.igd
  75. C_burnetii.cv-0_90.igd
  76. C_caviae.cv-0_90.igd
  77. C_chlorochromatii_CaD3.cv-0_90.igd
  78. C_crescentus.cv-0_90.igd
  79. C_diphtheriae.cv-0_90.igd
  80. C_efficiens_YS-314.cv-0_90.igd
  81. C_felis_Fe_C-56.cv-0_90.igd
  82. C_fetus_82-40.cv-0_90.igd
  83. C_glutamicum_ATCC13032_Bielefeld.cv-0_90.igd
  84. C_glutamicum_ATCC13032_Kitasato.cv-0_90.igd
  85. C_hutchinsonii_ATCC33406.cv-0_90.igd
  86. C_hydrogenoformans_Z-2901.cv-0_90.igd
  87. C_jeikeium_K411.cv-0_90.igd
  88. C_jejuni.cv-0_90.igd
  89. C_jejuni_81-176.cv-0_90.igd
  90. C_jejuni_RM1221.cv-0_90.igd
  91. C_muridarum.cv-0_90.igd
  92. C_novyi_NT.cv-0_90.igd
  93. C_perfringens.cv-0_90.igd
  94. C_perfringens_ATCC13124.cv-0_90.igd
  95. C_perfringens_SM101.cv-0_90.igd
  96. C_phaeobacteroides_DSM266.cv-0_90.igd
  97. C_pneumoniae_AR39.cv-0_90.igd
  98. C_pneumoniae_CWL029.cv-0_90.igd
  99. C_pneumoniae_J138.cv-0_90.igd
  100. C_pneumoniae_TW183.cv-0_90.igd
  101. C_psychrerythraea_34H.cv-0_90.igd
  102. C_ruddii.cv-0_90.igd
  103. C_ruddii_PV.cv-0_90.igd
  104. C_salexigens_DSM3043.cv-0_90.igd
  105. C_tepidum_TLS.cv-0_90.igd
  106. C_tetani_E88.cv-0_90.igd
  107. C_thermocellum_ATCC27405.cv-0_90.igd
  108. C_trachomatis.cv-0_90.igd
  109. C_trachomatis_A_HAR-13.cv-0_90.igd
  110. C_violaceum.cv-0_90.igd
  111. D_aromatica_RCB.cv-0_90.igd
  112. D_desulfuricans_G20.cv-0_90.igd
  113. D_ethenogenes_195.cv-0_90.igd
  114. D_geothermalis_DSM11300.cv-0_90.igd
  115. D_hafniense_Y51.cv-0_90.igd
  116. D_psychrophila_LSv54.cv-0_90.igd
  117. D_radiodurans.cv-0_90.igd
  118. D_vulgaris_DP4.cv-0_90.igd
  119. D_vulgaris_Hildenborough.cv-0_90.igd
  120. Dehalococcoides_CBDB1.cv-0_90.igd
  121. E_canis_Jake.cv-0_90.igd
  122. E_carotovora_atroseptica_SCRI1043.cv-0_90.igd
  123. E_chaffeensis_Arkansas.cv-0_90.igd
  124. E_coli_536.cv-0_90.igd
  125. E_coli_APEC_O1.cv-0_90.igd
  126. E_coli_CFT073.cv-0_90.igd
  127. E_coli_K12.cv-0_90.igd
  128. E_coli_O157H7.cv-0_90.igd
  129. E_coli_O157H7_EDL933.cv-0_90.igd
  130. E_coli_UTI89.cv-0_90.igd
  131. E_coli_W3110.cv-0_90.igd
  132. E_faecalis_V583.cv-0_90.igd
  133. E_litoralis_HTCC2594.cv-0_90.igd
  134. E_ruminantium_Gardel.cv-0_90.igd
  135. E_ruminantium_Welgevonden_Cirad.cv-0_90.igd
  136. E_ruminantium_Welgevonden_Onderstepoort.cv-0_90.igd
  137. F_alni_ACN14a.cv-0_90.igd
  138. F_nucleatum.cv-0_90.igd
  139. F_tularensis_FSC198.cv-0_90.igd
  140. F_tularensis_holarctica.cv-0_90.igd
  141. F_tularensis_holarctica_OSU18.cv-0_90.igd
  142. F_tularensis_novicida_U112.cv-0_90.igd
  143. F_tularensis_tularensis.cv-0_90.igd
  144. Frankia_CcI3.cv-0_90.igd
  145. G_bethesdensis_CGDNIH1.cv-0_90.igd
  146. G_forsetii_KT0803.cv-0_90.igd
  147. G_kaustophilus_HTA426.cv-0_90.igd
  148. G_metallireducens_GS-15.cv-0_90.igd
  149. G_oxydans_621H.cv-0_90.igd
  150. G_sulfurreducens.cv-0_90.igd
  151. G_violaceus.cv-0_90.igd
  152. H_acinonychis_Sheeba.cv-0_90.igd
  153. H_butylicus.cv-0_90.igd
  154. H_chejuensis_KCTC2396.cv-0_90.igd
  155. H_ducreyi_35000HP.cv-0_90.igd
  156. H_halophila_SL1.cv-0_90.igd
  157. H_hepaticus.cv-0_90.igd
  158. H_influenzae.cv-0_90.igd
  159. H_influenzae_86_028NP.cv-0_90.igd
  160. H_marismortui_ATCC43049.cv-0_90.igd
  161. H_neptunium_ATCC15444.cv-0_90.igd
  162. H_pylori_26695.cv-0_90.igd
  163. H_pylori_HPAG1.cv-0_90.igd
  164. H_pylori_J99.cv-0_90.igd
  165. H_somnus_129PT.cv-0_90.igd
  166. H_walsbyi.cv-0_90.igd
  167. Halobacterium_sp.cv-0_90.igd
  168. I_loihiensis_L2TR.cv-0_90.igd
  169. Jannaschia_CCS1.cv-0_90.igd
  170. L_acidophilus_NCFM.cv-0_90.igd
  171. L_borgpetersenii_Hardjo-bovis_JB197.cv-0_90.igd
  172. L_borgpetersenii_Hardjo-bovis_L550.cv-0_90.igd
  173. L_brevis_ATCC367.cv-0_90.igd
  174. L_casei_ATCC334.cv-0_90.igd
  175. L_delbrueckii_bulgaricus.cv-0_90.igd
  176. L_delbrueckii_bulgaricus_ATCC_BAA-365.cv-0_90.igd
  177. L_gasseri_ATCC33323.cv-0_90.igd
  178. L_innocua.cv-0_90.igd
  179. L_interrogans_Copenhageni.cv-0_90.igd
  180. L_interrogans_Lai.cv-0_90.igd
  181. L_intracellularis_PHE_MN1-00.cv-0_90.igd
  182. L_johnsonii_NCC533.cv-0_90.igd
  183. L_lactis.cv-0_90.igd
  184. L_lactis_cremoris_MG1363.cv-0_90.igd
  185. L_lactis_cremoris_SK11.cv-0_90.igd
  186. L_mesenteroides_ATCC8293.cv-0_90.igd
  187. L_monocytogenes.cv-0_90.igd
  188. L_monocytogenes_4b_F2365.cv-0_90.igd
  189. L_plantarum.cv-0_90.igd
  190. L_pneumophila_Lens.cv-0_90.igd
  191. L_pneumophila_Paris.cv-0_90.igd
  192. L_pneumophila_Philadelphia_1.cv-0_90.igd
  193. L_sakei_23K.cv-0_90.igd
  194. L_salivarius_UCC118.cv-0_90.igd
  195. L_welshimeri_6b_SLCC5334.cv-0_90.igd
  196. L_xyli_xyli_CTCB0.cv-0_90.igd
  197. M_acetivorans.cv-0_90.igd
  198. M_aquaeolei_VT8.cv-0_90.igd
  199. M_avium_104.cv-0_90.igd
  200. M_avium_paratuberculosis.cv-0_90.igd
  201. M_barkeri_fusaro.cv-0_90.igd
  202. M_bovis.cv-0_90.igd
  203. M_bovis_BCG_Pasteur_1173P2.cv-0_90.igd
  204. M_burtonii_DSM6242.cv-0_90.igd
  205. M_capricolum_ATCC27343.cv-0_90.igd
  206. M_capsulatus_Bath.cv-0_90.igd
  207. M_flagellatus_KT.cv-0_90.igd
  208. M_florum_L1.cv-0_90.igd
  209. M_gallisepticum.cv-0_90.igd
  210. M_genitalium.cv-0_90.igd
  211. M_hungatei_JF-1.cv-0_90.igd
  212. M_hyopneumoniae_232.cv-0_90.igd
  213. M_hyopneumoniae_7448.cv-0_90.igd
  214. M_hyopneumoniae_J.cv-0_90.igd
  215. M_jannaschii.cv-0_90.igd
  216. M_kandleri.cv-0_90.igd
  217. M_labreanum_Z.cv-0_90.igd
  218. M_leprae.cv-0_90.igd
  219. M_loti.cv-0_90.igd
  220. M_magneticum_AMB-1.cv-0_90.igd
  221. M_maripaludis_S2.cv-0_90.igd
  222. M_maris_MCS10.cv-0_90.igd
  223. M_mazei.cv-0_90.igd
  224. M_mobile_163K.cv-0_90.igd
  225. M_mycoides.cv-0_90.igd
  226. M_penetrans.cv-0_90.igd
  227. M_petroleiphilum_PM1.cv-0_90.igd
  228. M_pneumoniae.cv-0_90.igd
  229. M_pulmonis.cv-0_90.igd
  230. M_smegmatis_MC2_155.cv-0_90.igd
  231. M_stadtmanae.cv-0_90.igd
  232. M_succiniciproducens_MBEL55E.cv-0_90.igd
  233. M_synoviae_53.cv-0_90.igd
  234. M_thermoacetica_ATCC39073.cv-0_90.igd
  235. M_thermoautotrophicum.cv-0_90.igd
  236. M_thermophila_PT.cv-0_90.igd
  237. M_tuberculosis_CDC1551.cv-0_90.igd
  238. M_tuberculosis_H37Rv.cv-0_90.igd
  239. M_ulcerans_Agy99.cv-0_90.igd
  240. M_vanbaalenii_PYR-1.cv-0_90.igd
  241. M_xanthus_DK1622.cv-0_90.igd
  242. Magnetococcus_MC-1.cv-0_90.igd
  243. Mesorhizobium_BNC1.cv-0_90.igd
  244. Mycobacterium_KMS.cv-0_90.igd
  245. Mycobacterium_MCS.cv-0_90.igd
  246. N_aromaticivorans_DSM12444.cv-0_90.igd
  247. N_equitans.cv-0_90.igd
  248. N_europaea.cv-0_90.igd
  249. N_eutropha_C71.cv-0_90.igd
  250. N_farcinica_IFM10152.cv-0_90.igd
  251. N_gonorrhoeae_FA1090.cv-0_90.igd
  252. N_hamburgensis_X14.cv-0_90.igd
  253. N_meningitidis_FAM18.cv-0_90.igd
  254. N_meningitidis_MC58.cv-0_90.igd
  255. N_meningitidis_Z2491.cv-0_90.igd
  256. N_multiformis_ATCC25196.cv-0_90.igd
  257. N_oceani_ATCC19707.cv-0_90.igd
  258. N_pharaonis.cv-0_90.igd
  259. N_sennetsu_Miyayama.cv-0_90.igd
  260. N_winogradskyi_Nb-255.cv-0_90.igd
  261. Nocardioides_JS614.cv-0_90.igd
  262. Nostoc_sp.cv-0_90.igd
  263. O_iheyensis.cv-0_90.igd
  264. O_oeni_PSU-1.cv-0_90.igd
  265. O_yellows_phytoplasma.cv-0_90.igd
  266. P_abyssi.cv-0_90.igd
  267. P_acnes_KPA171202.cv-0_90.igd
  268. P_aeruginosa.cv-0_90.igd
  269. P_aeruginosa_UCBPP-PA14.cv-0_90.igd
  270. P_arcticum_273-4.cv-0_90.igd
  271. P_asteris.cv-0_90.igd
  272. P_atlantica_T6c.cv-0_90.igd
  273. P_carbinolicus.cv-0_90.igd
  274. P_cryohalolentis_K5.cv-0_90.igd
  275. P_denitrificans_PD1222.cv-0_90.igd
  276. P_entomophila_L48.cv-0_90.igd
  277. P_fluorescens_Pf-5.cv-0_90.igd
  278. P_fluorescens_PfO-1.cv-0_90.igd
  279. P_furiosus.cv-0_90.igd
  280. P_gingivalis_W83.cv-0_90.igd
  281. P_haloplanktis_TAC125.cv-0_90.igd
  282. P_horikoshii.cv-0_90.igd
  283. P_ingrahamii_37.cv-0_90.igd
  284. P_luminescens.cv-0_90.igd
  285. P_luteolum_DSM273.cv-0_90.igd
  286. P_marinus_AS9601.cv-0_90.igd
  287. P_marinus_CCMP1375.cv-0_90.igd
  288. P_marinus_MED4.cv-0_90.igd
  289. P_marinus_MIT9303.cv-0_90.igd
  290. P_marinus_MIT9312.cv-0_90.igd
  291. P_marinus_MIT9313.cv-0_90.igd
  292. P_marinus_MIT9515.cv-0_90.igd
  293. P_marinus_NATL1A.cv-0_90.igd
  294. P_marinus_NATL2A.cv-0_90.igd
  295. P_multocida.cv-0_90.igd
  296. P_naphthalenivorans_CJ2.cv-0_90.igd
  297. P_pentosaceus_ATCC25745.cv-0_90.igd
  298. P_profundum_SS9.cv-0_90.igd
  299. P_propionicus_DSM2379.cv-0_90.igd
  300. P_putida_KT2440.cv-0_90.igd
  301. P_syringae_B728a.cv-0_90.igd
  302. P_syringae_phaseolicola_1448A.cv-0_90.igd
  303. P_syringae_tomato_DC3000.cv-0_90.igd
  304. P_torridus_DSM9790.cv-0_90.igd
  305. P_ubique_HTCC1062.cv-0_90.igd
  306. Parachlamydia_UWE25.cv-0_90.igd
  307. Pirellula_sp.cv-0_90.igd
  308. Polaromonas_JS666.cv-0_90.igd
  309. R_bellii_RML369-C.cv-0_90.igd
  310. R_conorii.cv-0_90.igd
  311. R_denitrificans_OCh_114.cv-0_90.igd
  312. R_etli_CFN42.cv-0_90.igd
  313. R_eutropha_H16.cv-0_90.igd
  314. R_eutropha_JMP134.cv-0_90.igd
  315. R_felis_URRWXCal2.cv-0_90.igd
  316. R_ferrireducens_T118.cv-0_90.igd
  317. R_leguminosarum_viciae_3841.cv-0_90.igd
  318. R_magnifica_Cm.cv-0_90.igd
  319. R_metallidurans_CH34.cv-0_90.igd
  320. R_palustris_BisA53.cv-0_90.igd
  321. R_palustris_BisB18.cv-0_90.igd
  322. R_palustris_BisB5.cv-0_90.igd
  323. R_palustris_CGA009.cv-0_90.igd
  324. R_palustris_HaA2.cv-0_90.igd
  325. R_prowazekii.cv-0_90.igd
  326. R_rubrum_ATCC11170.cv-0_90.igd
  327. R_solanacearum.cv-0_90.igd
  328. R_sphaeroides_241.cv-0_90.igd
  329. R_typhi_wilmington.cv-0_90.igd
  330. R_xylanophilus_DSM9941.cv-0_90.igd
  331. Rhodococcus_RHA1.cv-0_90.igd
  332. S_aciditrophicus_SB.cv-0_90.igd
  333. S_acidocaldarius_DSM639.cv-0_90.igd
  334. S_agalactiae_2603.cv-0_90.igd
  335. S_agalactiae_A909.cv-0_90.igd
  336. S_agalactiae_NEM316.cv-0_90.igd
  337. S_alaskensis_RB2256.cv-0_90.igd
  338. S_amazonensis_SB2B.cv-0_90.igd
  339. S_aureus_COL.cv-0_90.igd
  340. S_aureus_MW2.cv-0_90.igd
  341. S_aureus_Mu50.cv-0_90.igd
  342. S_aureus_N315.cv-0_90.igd
  343. S_aureus_NCTC8325.cv-0_90.igd
  344. S_aureus_RF122.cv-0_90.igd
  345. S_aureus_USA300.cv-0_90.igd
  346. S_aureus_aureus_MRSA252.cv-0_90.igd
  347. S_aureus_aureus_MSSA476.cv-0_90.igd
  348. S_avermitilis.cv-0_90.igd
  349. S_boydii_Sb227.cv-0_90.igd
  350. S_coelicolor.cv-0_90.igd
  351. S_degradans_2-40.cv-0_90.igd
  352. S_denitrificans_OS217.cv-0_90.igd
  353. S_dysenteriae.cv-0_90.igd
  354. S_elongatus_PCC6301.cv-0_90.igd
  355. S_elongatus_PCC7942.cv-0_90.igd
  356. S_enterica_Choleraesuis.cv-0_90.igd
  357. S_enterica_Paratypi_ATCC9150.cv-0_90.igd
  358. S_epidermidis_ATCC12228.cv-0_90.igd
  359. S_epidermidis_RP62A.cv-0_90.igd
  360. S_flexneri_2a.cv-0_90.igd
  361. S_flexneri_2a_2457T.cv-0_90.igd
  362. S_flexneri_5_8401.cv-0_90.igd
  363. S_frigidimarina_NCIMB400.cv-0_90.igd
  364. S_fumaroxidans_MPOB.cv-0_90.igd
  365. S_glossinidius_morsitans.cv-0_90.igd
  366. S_haemolyticus.cv-0_90.igd
  367. S_meliloti.cv-0_90.igd
  368. S_mutans.cv-0_90.igd
  369. S_oneidensis.cv-0_90.igd
  370. S_pneumoniae_D39.cv-0_90.igd
  371. S_pneumoniae_R6.cv-0_90.igd
  372. S_pneumoniae_TIGR4.cv-0_90.igd
  373. S_pomeroyi_DSS-3.cv-0_90.igd
  374. S_pyogenes_M1_GAS.cv-0_90.igd
  375. S_pyogenes_MGAS10270.cv-0_90.igd
  376. S_pyogenes_MGAS10394.cv-0_90.igd
  377. S_pyogenes_MGAS10750.cv-0_90.igd
  378. S_pyogenes_MGAS2096.cv-0_90.igd
  379. S_pyogenes_MGAS315.cv-0_90.igd
  380. S_pyogenes_MGAS5005.cv-0_90.igd
  381. S_pyogenes_MGAS6180.cv-0_90.igd
  382. S_pyogenes_MGAS8232.cv-0_90.igd
  383. S_pyogenes_MGAS9429.cv-0_90.igd
  384. S_pyogenes_SSI-1.cv-0_90.igd
  385. S_ruber_DSM13855.cv-0_90.igd
  386. S_sanguinis_SK36.cv-0_90.igd
  387. S_saprophyticus.cv-0_90.igd
  388. S_solfataricus.cv-0_90.igd
  389. S_sonnei_Ss046.cv-0_90.igd
  390. S_thermophilum_IAM14863.cv-0_90.igd
  391. S_thermophilus_CNRZ1066.cv-0_90.igd
  392. S_thermophilus_LMD-9.cv-0_90.igd
  393. S_thermophilus_LMG18311.cv-0_90.igd
  394. S_tokodaii.cv-0_90.igd
  395. S_typhi.cv-0_90.igd
  396. S_typhi_Ty2.cv-0_90.igd
  397. S_typhimurium_LT2.cv-0_90.igd
  398. S_usitatus_Ellin6076.cv-0_90.igd
  399. S_wolfei_Goettingen.cv-0_90.igd
  400. Shewanella_ANA-3.cv-0_90.igd
  401. Shewanella_MR-4.cv-0_90.igd
  402. Shewanella_MR-7.cv-0_90.igd
  403. Shewanella_W3-18-1.cv-0_90.igd
  404. Silicibacter_TM1040.cv-0_90.igd
  405. Synechococcus_CC9311.cv-0_90.igd
  406. Synechococcus_CC9605.cv-0_90.igd
  407. Synechococcus_CC9902.cv-0_90.igd
  408. Synechococcus_JA-2-3Ba.cv-0_90.igd
  409. Synechococcus_JA-3-3Ab.cv-0_90.igd
  410. Synechococcus_WH8102.cv-0_90.igd
  411. Synechocystis_PCC6803.cv-0_90.igd
  412. T_acidophilum.cv-0_90.igd
  413. T_crunogena_XCL-2.cv-0_90.igd
  414. T_denitrificans_ATCC25259.cv-0_90.igd
  415. T_denitrificans_ATCC33889.cv-0_90.igd
  416. T_denticola_ATCC35405.cv-0_90.igd
  417. T_elongatus.cv-0_90.igd
  418. T_erythraeum_IMS101.cv-0_90.igd
  419. T_fusca_YX.cv-0_90.igd
  420. T_kodakaraensis_KOD1.cv-0_90.igd
  421. T_maritima.cv-0_90.igd
  422. T_pallidum.cv-0_90.igd
  423. T_pendens_Hrk_5.cv-0_90.igd
  424. T_tengcongensis.cv-0_90.igd
  425. T_thermophilus_HB27.cv-0_90.igd
  426. T_thermophilus_HB8.cv-0_90.igd
  427. T_volcanium.cv-0_90.igd
  428. T_whipplei_TW08_27.cv-0_90.igd
  429. T_whipplei_Twist.cv-0_90.igd
  430. U_urealyticum.cv-0_90.igd
  431. V_cholerae.cv-0_90.igd
  432. V_eiseniae_EF01-2.cv-0_90.igd
  433. V_fischeri_ES114.cv-0_90.igd
  434. V_parahaemolyticus.cv-0_90.igd
  435. V_vulnificus_CMCP6.cv-0_90.igd
  436. V_vulnificus_YJ016.cv-0_90.igd
  437. W_brevipalpis.cv-0_90.igd
  438. W_pipientis_wMel.cv-0_90.igd
  439. W_succinogenes.cv-0_90.igd
  440. Wolbachia_TRS-Bmalayi.cv-0_90.igd
  441. X_campestris.cv-0_90.igd
  442. X_campestris_8004.cv-0_90.igd
  443. X_campestris_vesicatoria_85-10.cv-0_90.igd
  444. X_citri.cv-0_90.igd
  445. X_fastidiosa.cv-0_90.igd
  446. X_fastidiosa_Temecula1.cv-0_90.igd
  447. X_oryzae_KACC10331.cv-0_90.igd
  448. X_oryzae_MAFF311018.cv-0_90.igd
  449. Y_enterocolitica_8081.cv-0_90.igd
  450. Y_pestis_Antiqua.cv-0_90.igd
  451. Y_pestis_CO92.cv-0_90.igd
  452. Y_pestis_KIM.cv-0_90.igd
  453. Y_pestis_Mediaevails.cv-0_90.igd
  454. Y_pestis_Nepal516.cv-0_90.igd
  455. Y_pseudotuberculosis_IP32953.cv-0_90.igd
  456. Z_mobilis_ZM4.cv-0_90.igd

Computational Genomics
Phylogenetic Profiles